在多年前的宇宙中，野心勃勃且妄图统治整个宇宙的黑暗大帝曾多次侵犯其他星球，并对环境造成了不可逆转的破坏。面对如此严重的威胁，正义之士——宇宙盟主北斗星王决定采取行动。经过一场激烈的宇宙大战之后，终于将黑暗大帝封印在了地球南极冰层之下，将他与世隔绝。为了确保黑暗大帝无法破解封印，北斗星王根据地球上一位高僧的指引，在冰封黑暗大帝的同时，在地球上发现了六只拥有超自然力量的神兽。随后，北斗星王利用自身掌握的高科技和北斗星能量，制造了六只与这些神兽相匹配的神兽金刚。这六只神兽金刚分别是：麒麟金刚、青龙金刚、白虎金刚、玄武金刚、朱雀金刚以及鹰龙金刚。同时，为了守护地球的安全，北斗星王将他的儿子——具有超异能的麒麟王和他忠诚的守护精灵小精灵一同留在了地球上。这样，在需要的时候，这些神兽金刚便能够被六位拥有超异能的小孩召唤出来，为维护地球和平、保护人类安全而战。
