自五年前Amazon几乎被彻底清除之后，世界逐渐恢复了和平。然而，随着时间的推移，感染了Amazon细胞的人类不断Amazon化，这引起了政府的高度关注。为此，一个新的秘密组织4C应运而生，其任务是秘密追踪并消灭这些Amazon化的个体。在这个新世界中，曾经在Amazon庇护下成长的少年千翼，凭借他觉醒的假面骑士Amazon Neo之力，继续与Amazon战斗。然而，在一次特殊的任务中，他遇到了一位名为优的少女——她以乌鸦形态现身，并作为生物兵器进行对抗。不同以往的是，千翼首次没有对优产生“想吃”的欲望，反而被她的存在深深吸引。随着故事的发展，优的真实身份逐渐浮出水面：她是被Amazon化的父亲杀害后，通过Sigma型复活的人类。这不仅揭示了Amazon化现象背后的复杂真相，也让千翼陷入了前所未有的情感纠葛中。在这个充满未知与危险的新世界里，他们必须共同面对 Amazon化人类带来的挑战，揭开隐藏在表面之下深邃的谜团。
